碎片化癌症药物反应矩阵中稀疏鲁棒排序的逆向项目反应理论

摘要

arXiv:2610.00002v1 Announce Type: new Abstract: We introduce reverse Item Response Theory (IRT) to pharmacogenomic drug-response analysis by treating cancer types as latent "subjects" with resistance ...

the drug cancer IRT latent with resistance and reverse types

2026-10-02 1 阅读约1分钟阅读 Jung Min Kang

arXiv:2610.00002v1 公告类型：新摘要：我们将反向项目反应理论（IRT）引入药物基因组药物反应分析中，将癌症类型视为具有抵抗能力的潜在“受试者”，将药物视为具有逃避困难的“项目”。该模型应用于癌症药物敏感性基因组学 (GDSC2) 数据库中的 242,036 项药物敏感性测量，在共享的潜在范围内估计癌症类型水平的体外耐药性和药物水平的广泛活性。四种缺失方案的验证表明，反向 IRT 比简单平均更好地恢复了完整数据的潜在排名，在 MCAR、癌症偏向和药物偏向稀疏性下，在 60% 缺失情况下具有 Delta-rho = +0.089 至 +0.095 的优势。保留预测证实 IRT 在五种评估方法中获得了最佳 Brier 分数。 Bootstrap 置信区间显示 28 种癌症类型中的 19 种具有稳定的耐药/敏感分类。跨平台 PRISM 复制显示出 82% 的方向一致性，但排序相关性较弱 (rho = 0.25)，表明贡献是分散评估下的方法稳健性，而不是通用的临床耐药排行榜。

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