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被英伟达点名的杭州团队,补上了AI for Science的「最后一公里」

2026-09-16 1 阅读 约9分钟阅读 杰西卡
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< img id="wx_img" src="https://www.qbitai.com/wp-content/uploads/imgs/qbitai-logo-1.png" width="400" height="400"> 被英伟达点名的杭州团队,补上了AI for Science的「最后一公里」 杰西卡 2026-09-16 11:40:35 来源: 量子位 杰西卡 发自 凹非寺 量子位 | 公众号 QbitAI AI for Science的竞争,正在向 科研闭环 延伸。 以 蛋白设计 为例,尽管蛋白模型越来越强,但真正想设计一个分子,研究人员还需要找文献、查结构,再下载权重、配置环境,把计算任务送上服务器。 等模型给出结果,还要换个工具看结构、做筛选,判断哪些候选值得继续……一次计算跑完,下一步从哪里开始,往往仍 靠研究人员把各个环节接起来 。 现在,这些隐藏在模型前后的工作,开始被AI公司重新审视。 今年4月, OpenAI 推出面向生命科学的 GPT-Rosalind ;6月, Anthropic 发布 Claude Science ;8月,Anthropic又公布Agent参与蛋白质设计、衔接外部实验验证的研究。 这些进展指向同一个变化:AI不再只负责模型本身的计算环节,也开始 参与模型前后的研究工作 ,可以分析结果、调整方案,继续推进任务。 国内,也已经有团队走到了类似的交叉路口。 杭州一家 AI蛋白质设计公司力文所 ,他们近日发布了 Lévin™ Harness , 面向科研社区开放使用 。 △图源:力文所Lévin™ Harness产品界面 它把数据、模型、插件工具、算力和工作流放进了同一个Agent工作区,由研究人员定义目标、方法和关键决策,Agent则据此推进计算、分析结果,再根据反馈调整下一轮方案。 在Lévin™ Harness中,用户可以选择专业的科学模型和分析工具完成蛋白质结构预测、序列设计等计算任务,但Lévin™ Harness本身不绑定特定模型,通用模型层保持开放。 新的模型和科学能力,还可以通过插件继续加入,任何人都可以为自己的模型、想加入Agent能力的模型制作 专属插件 。 不仅如此,一套研究方法跑通之后,还可以沉淀为 Workflow ,用于重复运行和继续修改。 Lévin™ Harness的核心职责,就是把模型、工具、算力和研究过程组织到同一条工作链上。 这解决的恰恰是AI for Science当下正在面临、比单次推理复杂得多的问题: 如何让这些智能真正进入科研现场,并且持续工作下去。 AI模型解决科学问题,Agent开始组织科研闭环 力文所发布的 Lévin™ Harness ,是一款 以Agent为核心的蛋白质设计应用 ,也可以近似理解为一个专门服务生命科学研究的Agent工作台。 在同一个工作台里,研究者可以提出目标、查看分子结构、组织计算,也可以在结果出现后修改方案。这些动作始终围绕同一个项目进行,前一步得到的信息能够继续供后一步使用。 这里的Agent,依靠 通用大模型 (DeepSeek、Kimi、GLM、Qwen、小米MiMo等开放模型)理解研究人员的需求、规划步骤,再调用相应工具执行任务,用户只需要用自然语言描述需求; 专门训练的科学模型和分析工具 会承担蛋白质结构预测、序列设计等计算任务。 △图源:力文所 Harness则负责连接这些能力与所需数据、算力,并保留研究过程。 研究人员只需负责科学目标、方法和关键决策,且随时可以审阅结果、补充条件或纠正方向。 这套分工,本质上是为了尽可能缩短 从想法到结果 的路径,让复杂的设计过程集中在同一个对话式工作环境里完成。即便是不懂程序的科研人员,也能快速完成蛋白质设计。 那么具体怎么实现这种 「端到端」 过程呢?可以用 蛋白binder设计任务 举个例子: binder是能够与目标蛋白结合的蛋白分子。传统的binder设计,需要研究人员弄清楚它需要结合哪个靶点、结合什么位置,以及希望通过这种结合实现什么目的。 明确这些问题后,团队才能给设计模型提出约束,生成候选,再筛选出值得投入实验的分子。 △AI生成 这条路径中的每一步,都会影响后面的选择。因此,任务从一开始,就需要把 文献、结构和设计条件 放在一起考虑。 而在Harness里,研究人员可以提出针对某个靶点设计binder的目标,由Agent参与靶点调研、整理相关信息,辅助分析可选择的结合位置,研究者再根据研究目的确定方法和约束,让后续计算有明确的方向。 不过这里可能存在一个问题,就是Agent需要 “看懂” 研究人员正在研究的分子。 蛋白质由氨基酸连接而成,链中的氨基酸单元通常被称为残基。这条链会折叠成三维结构,序列中相距很远的残基,可能在空间中彼此靠近。 Binder能否与靶点形成合适的结合界面,就与这些空间关系直接相关。所以研究人员选中了哪个残基、正在比较哪两种构象等信息,也需要纳入Agent的工作范围。 为此,力文所在Agent工作区内置了三维分子可视化工具,屏幕上的分子结构信息及相关操作,可以直接转化为Agent的上下文,让对话指向一个明确的研究对象。 △图源:力文所Lévin™ Harness产品界面 研究者在对话中提出“这里”这样的模糊词汇,Agent也能理解具体的空间位置;后续是否调整某个残基,进一步检查局部相互作用,也有了可供共同审阅的依据,结构分析因而能够跟着任务贯穿设计过程。 有了判断依据,下一步就是 把设计思路落实为计算 。 蛋白质设计领域已有不少专业工具出现,比如 AlphaFold 等模型用于结构预测, ProteinMPNN 可以为给定结构设计氨基酸序列, Pallatom 面向全原子蛋白质生成, RFantibody 则服务于抗体设计……Agent会根据任务意图自行选择相应能力。 △图源:力文所Lévin™ Harness产品界面 不过工具一旦多了,使用它们本身也会产生工作量。不同模型的输入、输出和运行环境未必一致,上一项计算的文件怎样交给下一项工具,设计条件怎样转换成参数,都需要有人处理。 为了解决这个问题,Lévin™ Harness通过定制的插件系统,把专业能力接进了同一套环境。 对于已经接入的插件,系统可以自动完成工具的下载、安装和调用,Agent再根据目标自行选择合适的工具、配置参数,串联相应计算。 而且用户还可以 继续通过插件加入新的模型和科学能力 ,搭建自己的专属插件,保留了研究方法的选择空间。 与此同时, 计算资源 同样接入了这条工作链。 结构生成和批量筛选常常需要持续运行GPU作业,Harness则可以连接本地工作站,或把任务提交到远程GPU服务器,让大型计算在后台进行,完成后再由Agent分析产物,推进后续步骤。 △图源:力文所Lévin™ Harness产品界面 回到binder任务,Agent此时能够组织候选生成与评估,并结合结构分析给出筛选依据。 不过,一轮计算结束,研究通常还没完成。如果候选没有满足约束,或是在不同评价项上表现不一,研究人员仍需要判断问题出在哪里。 这就需要 Workflow ,把这些能力组织成 可执行、可修改 的研究方法。体现在Harness中,就
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