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从 3D 结构预测跨膜蛋白拓扑
2026-09-28
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Sitong Chen, Xiaopeng Mao
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arXiv:2609.30446v1 公告类型:新 摘要:本文提出了一种使用最先进的图神经网络 (GNN) SchNet 推断蛋白质拓扑的新方法。该模型在用于开发最新 DeepTMHMM 模型的同一数据集上进行训练,并进行 5 倍交叉验证。与仅使用蛋白质序列或$\alpha$-碳作为特征的传统方法不同,我们以这种方式解码了我们的分类器,因此使用了所有原子级嵌入。在不应用任何预训练权重的情况下,最终结果显示了 GNN 可用于拓扑预测的巨大潜力。
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